Wir schreiben das Jahr 2012. Die Bevölkerung der Welt beträgt knappe 6 Millionen Menschen. Amerika, Europa, Asien, Afrika, Australien - alle wurden sie ausradiert. Nur Tokyo und einige kleinere Teile Japans existieren noch. Als Tokyo überraschend angegriffen wird, ist Kamina Ayato plötzlich auf sich alleine gestellt…